Das Antivirus Subsystem von POPcon PRO kann die Dateianhänge aller eingehenden Emails auf Viren überprüfen. Meldet der Virenscanner einen Virus, so kann mit der infizierten Email je nach Wahl so verfahren werden:

• Umleiten an den Postmaster: Der Postmaster (General Einstellungen) erhält die Email mit einem Vermerk und kann die Email dann nach eingehender Prüfung an den ursprünglichen Empfänger weiterleiten.
• Empfänger mit einer Warnung verpackt zustellen: Bei dieser Option erhält der ursprüngliche Empfänger die eventuell infizierte Email in einer Warnung verpackt zugestellt und muß selbst entscheiden, wie er sie handhaben will.
• Empfänger... und Kopie an Postmaster: Vereint die beiden oberen Optionen – sowohl der ursprüngliche Empfänger, als auch der Postmaster erhalten die infizierte Email in einer Warnung verpackt zugestellt.
• Nur löschen: Löscht Virusmail ohne sie an den Exchange-Server weiterzuleiten.

Der integrierte Scanner lädt aus dem Internet regelmäßig die neuesten Antivirus-Signaturen und bleibt so immer auf dem neuesten Stand. Der Überprüfung auf neue Signaturen geschieht wahlweise einmal  täglich oder einmal stündlich. Dabei werden die Signaturen in der Regel aber nur einmal täglich vom Antivirus-Supplier aktualisiert.